O Transtorno Depressivo Maior (TDM) é uma doença mental grave e comum que representa uma das principais causas de incapacidade global. A adolescência é um período crucial para a ocorrência e desenvolvimento da depressão , e existem distinções claras entre as apresentações da doença em adolescentes e adultos. A etiologia do TDM permanece obscura. No entanto, a análise de redes de coexpressão gênica é uma abordagem de biologia de sistemas que pode revelar interações complexas subjacentes à fisiopatologia do TDM.
WGCNA e o Módulo Chave
Um estudo recente aplicou a Análise de Rede de Coexpressão Gênica Ponderada (WGCNA) em dados de RNA-Seq de sangue periférico de adolescentes com TDM (primeiro episódio, não medicados) e controles saudáveis. O objetivo era identificar módulos de genes que estivessem altamente correlacionados com o TDM.
Identificação de Módulos: O WGCNA construiu oito módulos de coexpressão a partir de 18.930 genes.
Associação Chave: Apenas o módulo azul foi identificado como significativamente associado ao TDM.
Conexões com Estresse e Imunidade
As análises de enriquecimento funcional no módulo azul, que contém 215 genes , forneceram insights valiosos sobre os mecanismos moleculares internos do TDM.
Processos Biológicos (GO): Os genes do módulo azul estavam predominantemente envolvidos na regulação positiva da metilação de histonas, na regulação positiva da imunidade mediada por células T e na densidade pós-sináptica. A correlação entre a alteração epigenética (metilação de histonas) e a depressão reforça a hipótese de que o estresse ambiental está ligado ao transtorno.
Vias Moleculares (KEGG): As vias enriquecidas incluíram apoptose, sinalização de TNF e sinalização de NF-kappa. Essas vias estão associadas à resposta ao estresse e à imunidade, apoiando a hipótese inflamatória e neurodegenerativa da depressão.
Genes Centrais como Candidatos a Biomarcadores
Cinco genes com regulação negativa (down-regulated) foram identificados como genes centrais (hub genes) do TDM adolescente por meio da combinação de métodos:
IL1RAP (receptor de interleucina-1) : Ligado à inflamação.
UBE2W e UBE2D1 : Relevantes para a função imune e envolvidos no sistema ubiquitina-proteassoma. Sua regulação negativa sugere uma diminuição da função imune no TDM.
CNTNAP3 (Contactin Associated Protein 3): Associado a distúrbios psiquiátricos e ao reconhecimento celular de redes neurais. Sua regulação negativa pode indicar um enfraquecimento do prejuízo no neurocircuito.
MEGF9: Reconhecido por seu papel no desenvolvimento, manutenção e resposta a lesões do sistema nervoso. Sua disregulação sugere que o desenvolvimento do sistema nervoso e suas lesões estão intimamente correlacionados com o TDM na adolescência. MEGF9 é um potencial biomarcador específico para o TDM em adolescentes.
A identificação desses genes centrais reforça que o TDM está associado a estresse, inflamação e respostas imunes. O estudo, embora limitado pelo pequeno tamanho da amostra e pelo uso de sangue periférico em vez de tecido cerebral, destaca o potencial da análise modular para descobrir biomarcadores objetivos para o diagnóstico e tratamento do TDM em adolescentes.
Referência:
ZHAO, Bao et al. Identification of Key Modules and Genes Associated with Major Depressive Disorder in Adolescents. Genes, [S. l.], v. 13, n. 3, p. 464, 5 mar. 2022. doi:10.3390/genes13030464.
