O avanço da neurociência tem levado a um aumento significativo na complexidade dos estudos anatômicos do cérebro, tornando essencial o uso de ferramentas que possam lidar com grandes volumes de dados e garantir análises precisas. No entanto, muitas das soluções existentes são limitadas, exigindo que os pesquisadores desenvolvam fluxos de trabalho personalizados, muitas vezes sem conhecimento técnico em programação. Para preencher essa lacuna, foi criado o Campânula (Bell Jar), um software semiautomatizado, multiplataforma e de código aberto, acessível a pesquisadores de diferentes níveis de experiência.
Com o crescimento das técnicas de imagem de alta resolução, tornou-se comum lidar com centenas de seções de tecido cerebral em um único experimento. Métodos tradicionais de anotação manual são não apenas demorados, mas também suscetíveis a viés individual. A introdução de atlas digitais, como a Estrutura de Coordenadas Comuns do Cérebro de Allen (CCF), possibilitou maior precisão no mapeamento de regiões cerebrais, permitindo o alinhamento de tecidos experimentais com modelos digitais de referência.
Apesar dos avanços tecnológicos, muitas ferramentas ainda apresentam desafios, como dificuldades em corrigir deformações do tecido e a necessidade de ajustes manuais demorados. Algumas soluções utilizam aprendizado de máquina para aprimorar o alinhamento, mas dependem de dados volumétricos 3D e são difíceis de implementar em alguns laboratórios.
O Campânula se destaca ao oferecer um software de fácil instalação e uso, permitindo o alinhamento automático de tecidos experimentais ao Allen Brain CCF, além de fornecer ferramentas para quantificação de sinais experimentais sem a necessidade de conhecimentos avançados em programação. Construído com Electron.js e Python, o software funciona de maneira autônoma e modular, permitindo que os pesquisadores escolham entre diferentes ferramentas de alinhamento, detecção e contagem conforme suas necessidades.
Ao combinar automação, acessibilidade e flexibilidade, o Campânula representa um avanço significativo na análise de neuro-histologia, tornando o processamento de dados mais rápido, confiável e reprodutível para a comunidade científica. Para mais detalhes, consulte o estudo completo: Campânula: uma ferramenta semiautomatizada de registro e contagem de células para análise de neuro-histologia de camundongos | eNeuro
