Joglekar et al. (2024) apresentam um atlas abrangente de isoformas de RNA em células únicas de diferentes regiões cerebrais, subtipos celulares e estágios de desenvolvimento em camundongos. A pesquisa demonstrou que a expressão de isoformas de comprimento total varia em 72% dos genes, dependendo do tipo de célula, região cerebral e estágio de desenvolvimento.
Os autores descobriram que os sítios de splicing, início da transcrição e poliadenilação variam significativamente entre os tipos de células, influenciando a arquitetura das proteínas e associando-se à variação genética ligada a doenças. Além disso, genes envolvidos no transporte de neurotransmissores e na renovação de sinapses apresentam variabilidade entre tipos celulares em diferentes regiões anatômicas.
O estudo também revelou que a regulação do splicing específico do tipo celular é pronunciada na transição da adolescência, entre os dias 21 e 28 após o nascimento em camundongos. A regulação da isoforma durante o desenvolvimento é mais forte do que a regulação regional para o mesmo tipo de célula.
Em conclusão, este atlas detalhado de célula única da regulação de isoformas de comprimento total em diferentes estágios de desenvolvimento e regiões anatômicas revela um grau de variabilidade de isoformas em múltiplos eixos, com implicações importantes para a compreensão da função e desenvolvimento cerebral, bem como para o estudo de doenças neurológicas.
Referência:
JOGLEKAR, Anoushka et al. Single-cell long-read sequencing-based mapping reveals specialized splicing patterns in developing and adult mouse and human brain. Nature Neuroscience, v. 27, p. 1051–1063, 2024.
